大业十年底，大隋废📻总管府，在西域设西域都护府，🅊🄺黄🕾明辽成为大隋在西域的第一任都护。
都护府的权利比较笼统，但相较于总管府，肯🄙♤定是更加广大。总管府主要管军，军事目的更为重要。而都护府的职责是“抚慰诸藩，辑宁外寇”，凡对周边民族之“抚慰、征讨、叙功、罚过事宜”，皆其所统，主要目的是理藩。
西州总管府改西域都护府，使得黄🞅👭🌄明辽可以更加名正言顺🗼地管理西🞈域各属国了。
于是黄明辽继续经营伊吾、北庭、交河三郡，以为西域都护府的腹心之地。伊吾已经经营十多年；交河之地虽新附，但以汉人居多；而北庭更是西域都护府的驻地。三郡有汉民八万户，占据了整🔜🁡个西域汉民的七成。
三郡之中🕽🏃🗞，黄明辽兼任伊吾郡🌕⚠💷太守，李节兼任北庭郡太守。考虑到三郡下属只有十三个县，虽然面积广大，但实际上只是一个郡的体量。设置三个郡，既不方便管理，又多置机构，还使得都护府下的机构有些臃肿。
而且更重要的是，西域极其缺乏文官。西域之地缺乏纯文官生存的土壤，很多行政官员都是由军官改任的。黄明辽新🜭🅛置西域五镇，调走了大批文官，使得三郡文官更少🂪，不少人都是一人兼🃱🛨着好几个职务，极不稳妥。
于是黄明辽与李节商议，暂时搁置三郡，由都护府直接管🗼理下属各县。同时三郡的官府也皆裁撤，官员分配到🚁🐚各紧要🜭🅛之地。
而且最重要的是，由都护府直辖这十三县，就能保证这🕾八万🆭户汉民始终控制住都护府的手中，不至于生出旁的事情。
李节听了，也觉得有道理。整个西域的汉民、粮食、府库、工坊、马场多集中在这里，都护府牢牢控制住三郡直到，就🝐🐌相当于控制了西域诸军的命脉。
于是都♿🎇🎽护府下令裁撤三郡的郡府，由都护府直🄙♤接管辖三郡之中的十一个县的民政和军事。
被伊吾郡代管的且末、鄯善二县，与三郡隔着大沙海和莫贺延碛，从轮台前往二县，必须要绕道焉耆或者是敦煌，来往相当不便，于是将二县交给敦煌郡代管。并在蒲昌海（今新疆罗布泊）重设海头县，以为西域南🇰线🈺🃕🗭之屏障。
黄明辽又整合三郡兵马，分设四军，每军约四🄙♤千五百人，都护府直辖，由尉迟恭、暴固、慕容正言、史大奈四人分领，加上三郡下辖的各镇、戍、堡，共领兵三万两千余人。
当然，这也只是定额，缺员有上万之数。
不过四军的设立使得都护府随时可以调集一支成编制的集团军队，可应对西域出现的大部分⛰🞂⛰🞂挑战。
三郡🈫暂时废除之后，天山🁯以北只剩下了双河郡。黄明辽又命蒙跃总揽西北面军事，定兵额六千。
此时的西域，经过黄明辽的改制，形成了一个南北🎯🔪并进的双头鹫模式，类似于唐朝北庭⚩、安西二都护府分治的场面。
短时间内，没有中央政府的全力支🞅👭🌄持，西域都护府没有🕾能力继续西拓。但通过稳定的政治结构和强大的军事实力，也能保证整个天山南北🕈🇧局势的稳定。
······
冬去春来，到了大🚌👼业十一年，黄明辽一直👞处🔟🁺于紧张之中。
去年冬天的勃达岭之战，西突厥因为各种原因，不得不与大隋签订了不平等的条约，放弃了对天山以南的管辖权。虽然黄明辽也依约送西突厥的使节前往东⚳🕟都求亲，但射匮可汗是个自负的人，吃了这么大的亏，如何不从其它地方找🅈🄧⛦回场子。